Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IHHQ14623 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IHHQ14623 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IHHQ14623 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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