Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPARCL1Q14515 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPARCL1Q14515 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms