Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC3Q14003 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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