Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1CQ13936 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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