Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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