Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNASE1L3Q13609 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms