Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEUROD1Q13562 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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