Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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