Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF1Q13351 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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