Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC3Q13217 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC3Q13217 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms