Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAA1Q13131 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms