Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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