Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms