Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXO1Q12778 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXO1Q12778 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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