Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EP300Q09472 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EP300Q09472 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EP300Q09472 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EP300Q09472 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms