Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD47Q08722 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms