Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms