Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC6Q03468 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC6Q03468 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms