Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms