Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GCNT1Q02742 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms