Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TTC32-201ENST00000333610 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC008592.3-201ENST00000514941 418 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms