Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NHLH2Q02577 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NHLH2Q02577 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms