Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POU5F1Q01860 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.2 ms