Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms