Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms