Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PRCDQ00LT1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms