Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK6Q00534 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK6Q00534 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms