Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBBP68871 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBBP68871 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBBP68871 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBBP68871 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBBP68871 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBBP68871 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBBP68871 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms