Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS4XP62701 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS4XP62701 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms