Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS3AP61247 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms