Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAV3P56539 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms