Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SUMO3P55854 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms