Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNU13P55769 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNU13P55769 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNU13P55769 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms