Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV1P50549 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETV1P50549 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms