Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms