Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KRT6CP48668 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms