Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRB2P47870 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms