Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRXP46100 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATRXP46100 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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