Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGER3P43115 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms