Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGDSP41222 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms