Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FDFT1P37268 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms