Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD13P35453 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms