Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OTX2P32243 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTX2P32243 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTX2P32243 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms