Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms