Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA7P31268 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms