Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms