Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCD3P28288 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms