Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMNB1P20700 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms