Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNNI3P19429 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms