Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRF1P14222 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms